在地球上住着许多隐居在此的宇宙人。只有很少一部分的人类知道这个真相，一般大众并不知情。 在这样的社会之中，工藤优幸就职于包含外星人所引发的事件为业务内容的民间警备组织“Ｅ.Ｇ.Ｉ.Ｓ”日以继夜地为和平工作著。 而在优幸的身上却隐藏着连自己都不知道的秘密，那就是他的体内寄宿著泰迦奥特曼的光之粒子。当优幸体内的泰迦奥特曼苏醒的那一刻，新的故事开始了。